Dentro del Subsistema Educativo Estatal se instituye el Departamento de Capacitación y Actualización del Magisterio (DECAM, 1998 – 2001), que posteriormente, a partir del 2001, se convierte en el Departamento de Capacitación y Actualización Docente (DeCAD), fungiendo como la instancia que desarrollaba los programas de actualización y capacitación profesional de los maestros en servicio.
El Departamento de Capacitación y Actualización Docente cambia su denominación a Subdirección de Capacitación y Actualización Docente (SuCAD), al modificarse la estructura orgánica de la Secretaría de Educación en mayo de 2011, cuyo Manual General de Organización fue publicado en Gaceta del Gobierno en el año 2012.
Con fecha del 8 de marzo de 2017, se autorizó la nueva codificación de las unidades administrativas de la Secretaría de Educación, por lo que la Subdirección de Capacitación y Actualización cambia su denominación a Subdirección de Formación Continua, suyo objetivo es la capacitación y actualización de los docentes en servicio de tipo básico, con la finalidad de fortalecer el desarrollo profesional y contribuir de esta manera al logro de los aprendizajes de las niñas, niños y jóvenes.
Otra de las acciones de capacitación y actualización de gran relevancia de la Subdirección de Formación Continua, es sin lugar a duda el Programa de Período Sabático que se promueve año con año para los docentes en servicio, mediante convocatoria oficial que emite está, vía internet en la página oficial del Gobierno del Estado México y por medio de los 26 Centros de Maestros.
El 13 de junio de 2017, las funciones de la Subdirección se renovaron y se publicaron en el nuevo Manual General de Organización de la Secretaría de Educación.
Posteriormente en febrero de 2021 mediante el Periódico Oficial Gaceta del Gobierno, Tomo CCXII, número 118, la Secretaría de Finanzas autorizó a la Secretaria de Educación, la eliminación de la Subsecretaria General de educación, quedando conformada por: 1 Secretaría, 9 unidades staff de Secretaría, 4 Subsecretarías, 12 unidades staff de la Subsecretaría, 11 Direcciones Generales, 29 Direcciones de Área, 36 Subdirecciones, 9 Departamentos y 3 Delegaciones Administrativas, en total 114 unidades administrativas.
Estableciendo objetivos y funciones para la Subdirección de Formación Continua.